RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 GPBAR1Q8TDU6 330 aa22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 GUCY1B2O75343 617 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SMIM18P0DKX4 95 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 THRBP10828 461 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ARFIP1P53367 373 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 HSPB3Q12988 150 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SCARB2Q14108 478 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR18Q14330 331 aa22.77■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 PAQR7Q86WK9 346 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 OR10G6Q8NH81 332 aa22.77■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 FAM192AQ9GZU8 254 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.77■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 U3KQV3 271 aa22.77■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 GSAPA4D1B5 854 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF217O75362 1048 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PGM3O95394 542 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 H6PDO95479 791 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TGM3Q08188 693 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SLAMF1Q13291 335 aa22.76■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 OR8K5Q8NH50 307 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXL20Q96IG2 436 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM4Q9C037 500 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PADI4Q9UM07 663 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 hCG_2039718K7EN88 272 aa22.75■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 SH3BP5O60239 455 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 NOBOXO60393 691 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CTSEP14091 401 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 DCTP40126 519 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGDIAP52565 204 aa22.75■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 RLN3Q8WXF3 142 aa22.75■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 POT1Q9NUX5 634 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 EHD3Q9NZN3 535 aa22.75■■□□□ 1.23
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RPUSD1-201ENST00000007264 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 DSTNP60981 165 aa22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CDK6Q00534 326 aa22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 RGS1Q08116 209 aa22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 EPS8Q12929 822 aa22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHDC7BQ96G42 594 aa22.74■■□□□ 1.23
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