RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000116433.1

Zkscan3-202, Transcript of Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Zkscan3, Length 1,421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 ClcnkbQ9WUB6 687 aa14.91□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Slc22a4Q9Z306 553 aa14.91□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Gm14443A2ARX0 610 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Serpinb6eI7HJI3 429 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Kcnk1O08581 336 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Mdh1P14152 334 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 CtgfP29268 348 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Pdcd2P46718 343 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Epb42P49222 691 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Cdkn2cQ60772 168 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Six3Q62233 333 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Spata24Q6P926 205 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Spag1Q80ZX8 901 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Crispld2Q8BZQ2 495 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Lin28aQ8K3Y3 209 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Thoc3Q8VE80 351 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Olfr48Q8VGN4 301 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Olfr1414Q8VGU5 312 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Sh3bp4Q921I6 962 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Spred1Q924S8 444 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Ssr2Q9CPW5 183 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Nt5c3aQ9D020 331 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Dtwd1Q9D8U7 304 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 MefvQ9JJ26 767 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Dusp13Q9QYJ7 198 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Tln1P26039 2541 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Myo9aQ8C170 2542 aa14.9□□□□□ -0.02
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Kbtbd2G3X9X1 623 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Clk4O35493 481 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 ChgbP16014 677 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Cox5bP19536 128 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Adra2bP30545 450 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Tubb5P99024 444 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Meaf6Q2VPQ9 191 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Rsrp1Q3UC65 298 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Tab3Q571K4 716 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 PmelQ60696 626 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Zic2Q62520 530 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Fam189a1Q6A044 515 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Tmem151aQ6GQT5 468 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Ckmt2Q6P8J7 419 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 SetmarQ80UJ9 309 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Sulf2Q8CFG0 875 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Efcab7Q8VDY4 628 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Golga7Q91W53 137 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 NlnQ91YP2 704 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Grpel1Q99LP6 217 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Cysrt1Q9D1E4 142 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Oma1Q9D8H7 521 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 KelQ9EQF2 713 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Shank1D3YZU1 2167 aa14.89□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 MpdzQ8VBX6 2055 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Gm3752A6NAT4 150 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Chrna10B2RX82 447 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Tmed7D3YZZ5 224 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 PiggD3Z3Y1 983 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 2210016F16RikG3X8U3 338 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Gm10340K7N708 205 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Stxbp1O08599 594 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Nipsnap2O55126 281 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 F2rl3O88634 396 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Drd3P30728 446 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Ptx3P48759 381 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 EpxP49290 716 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Hnf4aP49698 474 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Ube2e3P52483 207 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Adra2cQ01337 458 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 RalgdsQ03385 852 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Lemd1Q14C37 129 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Trp53i11Q4QQM4 189 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Olfr10Q60883 311 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Klhdc10Q6PAR0 439 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Kctd12Q6WVG3 327 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Lrrc1Q80VQ1 524 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Atg4dQ8BGV9 474 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Itih5Q8BJD1 952 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Rnf122Q8BP31 155 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Zbtb20Q8K0L9 741 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Slc16a14Q8K1C7 512 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Olfr1090Q8VGA6 313 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Prss42Q8VIF2 335 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Lgals12Q91VD1 314 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 WacQ924H7 646 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 PigqQ9QYT7 581 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Parp4E9PYK3 1969 aa14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Zfyve26Q5DU37 2529 aa14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 2010106E10RikA2ANY3 279 aa14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Obp2bA2BHR0 176 aa14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Wscd2D4PHA7 571 aa14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Vmn2r102L7N279 857 aa14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3-202ENSMUST00000116433 Gm3187M0QWW3 260 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.2 ms