RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 MYOTQ9UBF9 498 aa8□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 DOCK7Q96N67 2140 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 TRBC2A0A5B9 178 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 RNF212BA8MTL3 300 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 A8MUA0 341 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 G3V3Y1 287 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 OR1F1O43749 312 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 OR6B1O95007 311 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 VAPBO95292 243 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 IFNB1P01574 187 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 HRGP04196 525 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 PAMP19021 973 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 TIMP3P35625 211 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 GRIA1P42261 906 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CCR8P51685 355 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CLCN7P51798 805 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 SP140Q13342 867 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CUL1Q13616 776 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 SLC10A1Q14973 349 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 OPN5Q6U736 354 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 HSDL2Q6YN16 418 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 PALM2Q8IXS6 379 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC89Q8N998 374 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 NT5CQ8TCD5 201 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ALG3Q92685 438 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 NTNG2Q96CW9 530 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC138Q96M89 665 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 DACH2Q96NX9 599 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 BFARQ9NZS9 450 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 PAK5Q9P286 719 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 MPDZO75970 2070 aa7.99□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ARID1AO14497 2285 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 A0A088AWK7 358 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 GFYI3L273 518 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CLDN4O14493 209 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 IFNA2P01563 188 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 C8GP07360 202 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CELA3AP09093 270 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 FPR1P21462 350 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ARNTP27540 789 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 NMBRP28336 390 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 OPRM1P35372 400 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 AHRP35869 848 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 DNASE1L1P49184 302 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 RGS4P49798 205 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 GPR143P51810 404 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 HK2P52789 917 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 HSD17B7P56937 341 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 KCNJ2P63252 427 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CRADDP78560 199 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 FOXO1Q12778 655 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 SLC13A2Q13183 592 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 POU4F3Q15319 338 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ARMC3Q5W041 872 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 AADACL2Q6P093 401 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 NAXEQ8NCW5 288 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 OR8K3Q8NH51 312 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HLA-B-257ENST00000640094 ISL2Q96A47 359 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms