RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 GPAMQ9HCL2 828 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PPT2Q9UMR5 302 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 A0A0G2JMM0 328 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PPB8 328 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PRS3 328 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FAM187AA6NFU0 413 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FCHO1O14526 889 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PRRG2O14669 202 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 RAD51CO43502 376 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PEX1O43933 1283 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 HS6ST1O60243 411 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PRAMEF4O60810 478 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ITGA10O75578 1167 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PIAS1O75925 651 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SSTR2P30874 369 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SLC6A12P48065 614 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R39P59534 338 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MORF4L2Q15014 288 aa11.28□□□□□ -0.6
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CTIF-208ENST00000590422 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CEP97Q8IW35 865 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PDIK1LQ8N165 341 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 RPRMLQ8N4K4 120 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FAM47BQ8NA70 645 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 NCLNQ969V3 563 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TMEM125Q96AQ2 219 aa11.28□□□□□ -0.6
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CTIF-208ENST00000590422 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CSF3RQ99062 836 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MCMBPQ9BTE3 642 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 DEPPQ9NTK1 212 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 OARD1Q9Y530 152 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MTORP42345 2549 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 PINLYPA6NC86 204 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 URADA6NGE7 173 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 E7ESA3 106 aa11.27□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 WDR47O94967 919 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TPOP07202 933 aa11.27□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 CLCN2P51788 898 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 GPR143P51810 404 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CDKL1Q00532 357 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TERF2Q15554 542 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 FBXO48Q5FWF7 155 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 C8orf74Q6P047 294 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.27□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 POGLUT1Q8NBL1 392 aa11.27□□□□□ -0.61
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CTIF-208ENST00000590422 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 RHBDF1Q96CC6 855 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 LRRC39Q96DD0 335 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 C14orf79Q96F83 325 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 QRFPRQ96P65 431 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 EGFL8Q99944 293 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.27□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.26□□□□□ -0.61
CTIF-208ENST00000590422 LRIT2A6NDA9 550 aa11.26□□□□□ -0.61
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