RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM198Q66K66 360 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 OGFOD2Q6N063 350 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DHRS13Q6UX07 377 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PPM1MQ96MI6 270 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 NRTNQ99748 197 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ADA2Q9NZK5 511 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 BBIP1A8MTZ0 92 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 LILRA1O75019 489 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 CD63P08962 238 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 COX4I1P13073 169 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CD59P13987 128 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CALB2P22676 271 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PCDH1Q08174 1060 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 KCNAB1Q14722 419 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf189Q5VU69 101 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 FCRL6Q6DN72 434 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 BHLHB9Q6PI77 547 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 NT5CQ8TCD5 201 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 SPDL1Q96EA4 605 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 C3orf14Q9HBI5 128 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PDPK1O15530 556 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 B4GALT2O60909 372 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 NUDT2P50583 147 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 SQSTM1Q13501 440 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 PAOXQ6QHF9 649 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 KCT2Q8NC54 265 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 C16orf78Q8WTQ4 265 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRO-210ENST00000544244 CROTQ9UKG9 612 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 VPS4AQ9UN37 437 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PLXNA2O75051 1894 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf226A1L170 272 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 LRIT2A6NDA9 550 aa5.39□□□□□ -1.55
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