RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525152.1

PPP6R3-208, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 2

Gene PPP6R3, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-208	ENST00000525152	STMN1	P16949	149 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF24	P17028	368 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	PTGER4	P35408	488 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	RAB38	P57729	211 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	EID3	Q8N140	333 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	CCT6B	Q92526	530 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	VMP1	Q96GC9	406 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	SERINC2	Q96SA4	455 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRRG2	O14669	202 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	CD1D	P15813	335 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	ABO	P16442	354 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	SSTR1	P30872	391 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	GPR143	P51810	404 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	TGM3	Q08188	693 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	GPR22	Q99680	433 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	RBBP8	Q99708	897 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	CCDC77	Q9BR77	488 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	WWOX	Q9NZC7	414 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	DAPP1	Q9UN19	280 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CTNS	O60931	367 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ITGA10	O75578	1167 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZFAND5	O76080	213 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TFEB	P19484	476 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	GP5	P40197	560 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CASP2	P42575	452 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PLA2G16	P53816	162 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	MTTP	P55157	894 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TBCC	Q15814	346 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	XKR6	Q5GH73	641 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PDPR	Q8NCN5	879 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152		A0A0G2JN53	185 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152		E9PLN8	166 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CYR61	O00622	381 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PEX1	O43933	1283 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PIAS1	O75925	651 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CLDN14	O95500	239 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	COX6B1	P14854	86 aa		13.94	□□□□□ -0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms