RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MAP10	Q9P2G4	905 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ITPR2	Q14571	2701 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FXYD1	O00168	92 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SEMA3D	O95025	777 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FKBP9	O95302	570 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SHMT2	P34897	504 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	GSTM5	P46439	218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NFYC	Q13952	458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AMZ1	Q400G9	498 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NAGS	Q8N159	534 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TTL	Q8NG68	377 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SH3GL1	Q99961	368 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MENT	Q9BUN1	341 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RHBG	Q9H310	441 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CD300A	Q9UGN4	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	KCNK6	Q9Y257	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	DUX1	O43812	170 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PDE5A	O76074	875 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	IL12A	P29459	219 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ALDH4A1	P30038	563 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	GPR3	P46089	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CCR8	P51685	355 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ARFIP1	P53367	373 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	REEP5	Q00765	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PWP1	Q13610	501 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FLOT2	Q14254	428 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	KRT33B	Q14525	404 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RPE65	Q16518	533 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FAM129C	Q86XR2	697 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HBEGF	Q99075	208 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RMND5A	Q9H871	391 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AHSP	Q9NZD4	102 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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