RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MRGPREQ86SM8 312 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HPS6Q86YV9 775 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 Q8NA96 180 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MFSD9Q8NBP5 474 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TRPV3Q8NET8 790 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 OR7G3Q8NG95 312 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SSC4DQ8WTU2 575 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SELENOMQ8WWX9 145 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 C17orf62Q9BQA9 187 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SIKE1Q9BRV8 207 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RHBGQ9H310 441 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NMRK1Q9NWW6 199 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PSD3Q9NYI0 1048 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 LRRK2Q5S007 2527 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0J9YVX5 310 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 A1L4Q6 167 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SERTM1A2A2V5 107 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SLC28A1O00337 649 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PEX12O00623 359 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TXNDC9O14530 226 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HCRTR1O43613 425 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HSD3B1P14060 373 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HSD3B2P26439 372 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINB3P29508 390 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FOLR3P41439 243 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SCTRP47872 440 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SEC24CP53992 1094 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FOXA1P55317 472 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DCDP81605 110 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZIC1Q15915 447 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 IMPG1Q17R60 797 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SGO1Q5FBB7 561 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RNF165Q6ZSG1 346 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DDIASQ8IXT1 998 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC22Q8N4W6 341 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC1AQ8NC01 280 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF740Q8NDX6 193 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PRR7Q8TB68 274 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 WDR20Q8TBZ3 569 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PNPLA2Q96AD5 504 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 KCNA7Q96RP8 456 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 BRF2Q9HAW0 419 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TXLNGQ9NUQ3 528 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NDOR1Q9UHB4 597 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PLCL2Q9UPR0 1127 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 BSNQ9UPA5 3926 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NBASA2RRP1 2371 aa10.75□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 URADA6NGE7 173 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM233B4DJY2 109 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RGS14O43566 566 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CTSVO60911 334 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC3AO75596 197 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PDYNP01213 254 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ALPPP05187 535 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CTSBP07858 339 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RNF224P0DH78 156 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 BCL6P41182 706 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NEK2P51955 445 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FOXL2P58012 376 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SSPNQ14714 243 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RHBDD2Q6NTF9 364 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CHSY3Q70JA7 882 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RNF44Q7L0R7 432 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms