RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAN	P16112	2415 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BMM5	538 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO1C	O00159	1063 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX1	O43933	1283 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK8	O60259	260 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPSNAP2	O75323	286 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MATN4	O95460	622 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ERG	P11308	486 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	HLCS	P50747	726 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP107	P57740	925 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR85	P60893	370 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF4	P78317	190 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PLGLB1	Q02325	96 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RELA	Q04206	551 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CLC	Q05315	142 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MPP5	Q8N3R9	675 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RPRML	Q8N4K4	120 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM156	Q8N614	296 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX13	Q92968	403 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT7	O00154	380 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF5C	O60282	957 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAG2	O75638	210 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A8	O95907	504 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	APRT	P07741	180 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	IL10	P22301	178 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	JAK1	P23458	1154 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5D	P30049	168 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GRK3	P35626	688 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FDFT1	P37268	417 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIA1	P42261	906 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MLF1	P58340	268 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RHAG	Q02094	409 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PCID2	Q5JVF3	399 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPG	Q86U10	573 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	VSTM4	Q8IW00	320 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ELP5	Q8TE02	316 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF480	Q8WV37	535 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1F2P	Q96R84	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	LIME1	Q9H400	295 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF114	Q9Y508	228 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FEZF1	A0PJY2	475 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511		E7ENX8	843 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALT2	O60909	372 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FH	P07954	510 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	HRH2	P25021	359 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SKP1	P63208	163 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MPP1	Q00013	466 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TAP2	Q03519	686 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GXYLT1	Q4G148	440 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PCGF5	Q86SE9	256 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG3	Q92685	438 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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