RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 PIK3CGP48736 1102 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 MTTPP55157 894 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 SLC26A5P58743 744 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 GTF2H2Q13888 395 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 CNPY4Q8N129 248 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 C19orf60Q96EN9 201 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 DAPP1Q9UN19 280 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 VPS4AQ9UN37 437 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 CLDN16Q9Y5I7 305 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-208ENST00000494971 DYTNA2CJ06 578 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 H0YIV9 168 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 SCELO95171 688 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 MYBL2P10244 700 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 PCNAP12004 261 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 MAOAP21397 527 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 CERS1P27544 350 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 TNFRSF8P28908 595 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 PIK3CBP42338 1070 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 TNFSF10P50591 281 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 LIM2P55344 173 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 HSD17B7P56937 341 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ARG2P78540 354 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 SLC29A2Q14542 456 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ZNF793Q6ZN11 406 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 CHSY3Q70JA7 882 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ZNF595Q8IYB9 648 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 CATSPER1Q8NEC5 780 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ELP5Q8TE02 316 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 CNDP1Q96KN2 507 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 IPPKQ9H8X2 491 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ACTR8Q9H981 624 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ESPL1Q14674 2120 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 LRRK2Q5S007 2527 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 COL12A1Q99715 3063 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 TRAV17A0A0B4J275 112 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 SAGE2PA6NJ88 616 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 CYR61O00622 381 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 SMIM24O75264 130 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 WDPCPO95876 746 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 SBK3P0C264 359 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 RCN2Q14257 317 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 DEPDC1Q5TB30 811 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ABHD17BQ5VST6 288 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 LCA5Q86VQ0 697 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 TMEM52Q8NDY8 209 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 HUS1BQ8NHY5 278 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 PHF21BQ96EK2 531 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 SCYL1Q96KG9 808 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ZNF354BQ96LW1 612 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 NPAS2Q99743 824 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 KCNK13Q9HB14 408 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 LYRM4Q9HD34 91 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 DMRT3Q9NQL9 472 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 PLA2G3Q9NZ20 509 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 STMN3Q9NZ72 180 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 KCMF1Q9P0J7 381 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 PCTPQ9UKL6 214 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 TGFBR3LH3BV60 316 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 CLDN4O14493 209 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 OR7A17O14581 309 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 TGFB1P01137 390 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 UQCRHP07919 91 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 GNLYP22749 145 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 UQCRFS1P47985 274 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-208ENST00000494971 ARFIP1P53367 373 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms