RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 TGM3Q08188 693 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PLAG1Q6DJT9 500 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ZNF793Q6ZN11 406 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 TIFABQ6ZNK6 161 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 FAM47BQ8NA70 645 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 HUS1BQ8NHY5 278 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PPP4R1Q8TF05 950 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 MTBPQ96DY7 904 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CDK15Q96Q40 435 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 LMF1Q96S06 567 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SERINC2Q96SA4 455 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CSF3RQ99062 836 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 LPAR4Q99677 370 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 A0A088AWK7 358 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SMIM23A6NLE4 172 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 OR7A17O14581 309 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 STX16O14662 325 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PYGBP11216 843 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TSPAN8P19075 237 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TNFRSF8P28908 595 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SLCO1A2P46721 670 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 NEK2P51955 445 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CCNG1P51959 295 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MTTPP55157 894 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 LIM2P55344 173 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 RAB38P57729 211 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ARG2P78540 354 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 LIPJQ5W064 366 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 IQCKQ8N0W5 287 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 OR52B6Q8NGF0 335 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MZB1Q8WU39 189 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CMTM7Q96FZ5 175 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 KCNC2Q96PR1 638 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 KCNK13Q9HB14 408 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 DMRT3Q9NQL9 472 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TMEM216Q9P0N5 145 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 FETUBQ9UGM5 382 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PCTPQ9UKL6 214 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TMCO1Q9UM00 188 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PPM1 405 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 A8MT66 165 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 H0YIV9 168 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MAN1A2O60476 641 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 UGDHO60701 494 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CLDN9O95484 217 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 WDPCPO95876 746 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 GNLYP22749 145 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PPP2R1BP30154 601 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SERPINB1P30740 379 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PIK3CBP42338 1070 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SSR2P43308 183 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 UQCRFS1P47985 274 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SLC26A5P58743 744 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 VSNL1P62760 191 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 AP2B1P63010 937 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ZNF33BQ06732 778 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SLC13A2Q13183 592 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 EXT1Q16394 746 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms