RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 SNX21Q969T3 373 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 MOCOSQ96EN8 888 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SPATA13Q96N96 652 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ERGIC2Q96RQ1 377 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 IWS1Q96ST2 819 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PCDHB18PQ96TA0 734 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 KRT12Q99456 494 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 IL12RB2Q99665 862 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 MED20Q9H944 212 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SPG21Q9NZD8 308 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 STX8Q9UNK0 236 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ZNF510Q9Y2H8 683 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 WIPI2Q9Y4P8 454 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 OR1A2Q9Y585 309 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 TEX264Q9Y6I9 313 aa2.71□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 GON4LQ3T8J9 2241 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 CHUKO15111 745 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ARHGEF9O43307 516 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PI15O43692 258 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 VEGFDO43915 354 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 CRCPO75575 148 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ANGPTL1O95841 491 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 AOC1P19801 751 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ACKR3P25106 362 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 COPB2P35606 906 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 HNF4AP41235 474 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SLC1A3P43003 542 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 TSFMP43897 325 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 TNFSF10P50591 281 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 AP1B1Q10567 949 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 LY6DQ14210 128 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PPA1Q15181 289 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ACKR1Q16570 336 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 C3AR1Q16581 482 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 MOGAT2Q3SYC2 334 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ZNF789Q5FWF6 425 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 FGD3Q5JSP0 725 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PLPP4Q5VZY2 271 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PRSS42Q7Z5A4 293 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 KCNMB4Q86W47 210 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 TMEM126BQ8IUX1 230 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 TRPV3Q8NET8 790 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 LPCAT1Q8NF37 534 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PRSS33Q8NF86 280 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 OR5T2Q8NGG2 359 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SPATA18Q8TC71 538 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SSC4DQ8WTU2 575 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 GGHQ92820 318 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 VGLL1Q99990 258 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 NACAP1Q9BZK3 213 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 CXXC4Q9H2H0 198 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 NUDT4Q9NZJ9 180 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 FBXW2Q9UKT8 454 aa2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SLC15A5A6NIM6 579 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 H7C423 109 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 M0R296 226 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 PSMD3O43242 534 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 IDH3BO43837 385 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 RTN2O75298 545 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 RAD51DO75771 328 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 KRT3P12035 628 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 DPEP1P16444 411 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 UGT1A6P19224 532 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 UGT1A4P22310 534 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 GIFP27352 417 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 GPR183P32249 361 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 CASP3P42574 277 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 LUMP51884 338 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 KIAA1024LP59773 190 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SLC34A1Q06495 639 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 SLC3A1Q07837 685 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 RPS6KA1Q15418 735 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 WSCD2Q2TBF2 565 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 WLSQ5T9L3 541 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ZNF613Q6PF04 617 aa2.69□□□□□ -1.98
SENP6-208ENST00000483859 ZER1Q7Z7L7 766 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms