RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 FAR2Q96K12 515 aa26.09■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 LRBAP50851 2863 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 CLGNO14967 610 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 GPR143P51810 404 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 RAB38P57729 211 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 E2F2Q14209 437 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 PDK4Q16654 411 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 XKR6Q5GH73 641 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC25A25Q6KCM7 469 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 UBE3DQ7Z6J8 389 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 LURAP1LQ8IV03 231 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 F2RL3Q96RI0 385 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 CSF3RQ99062 836 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 ALG9Q9H6U8 611 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 PRDM7Q9NQW5 492 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 IGSF5Q9NSI5 407 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 RNF112Q9ULX5 631 aa26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TRIOBP-209ENST00000428075 PCNX1Q96RV3 2341 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKDD1BA6NHY2 528 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CYR61O00622 381 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CERS1P27544 350 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CAV1Q03135 178 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 RNFT1Q5M7Z0 435 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM47BQ8NA70 645 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM178AQ8NBL3 297 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ARMC2Q8NEN0 867 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 B3GNT7Q8NFL0 401 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 EXT2Q93063 718 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC120Q96HB5 630 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 GPR137Q96N19 417 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ATOH8Q96SQ7 321 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CD244Q9BZW8 370 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa26.07■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 B3GALT2O43825 422 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC25A12O75746 678 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 MYO1DO94832 1006 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 TFEBP19484 476 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CASP2P42575 452 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 LIM2P55344 173 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 HSD17B7P56937 341 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CHIT1Q13231 466 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 EFCAB11Q9BUY7 163 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 RAB17Q9H0T7 212 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 KCMF1Q9P0J7 381 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF835Q9Y2P0 537 aa26.06■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 HMX2A2RU54 273 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CCL21O00585 134 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CDK2AP1O14519 115 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 NME2P1O60361 137 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC19A2O60779 497 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 NME2P22392 152 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 HLCSP50747 726 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 TERF2Q15554 542 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 TBCCQ15814 346 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 C3AR1Q16581 482 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF793Q6ZN11 406 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 HORMAD2Q8N7B1 307 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 SERINC2Q96SA4 455 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 DEFB126Q9BYW3 111 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 DAPP1Q9UN19 280 aa26.05■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 MYO9AB2RTY4 2548 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ESYT3A0FGR9 886 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 NPIPA5E9PKD4 350 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 UBXN8O00124 270 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNHIT1O43257 154 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 MTHFD2P13995 350 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CYB561P49447 251 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 MTTPP55157 894 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC7A5Q01650 507 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 SLMAPQ14BN4 828 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 MAPKAPK3Q16644 382 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM40Q6P9F5 258 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CLNKQ7Z7G1 428 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 STAG3L4Q8TBR4 150 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 NXNL1Q96CM4 212 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 MS4A8Q9BY19 250 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 NUDT4Q9NZJ9 180 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 NPIPA1Q9UND3 350 aa26.04■■□□□ 1.76
TRIOBP-209ENST00000428075 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa26.03■■□□□ 1.76
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