RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 URADA6NGE7 173 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SCELO95171 688 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PGRP06401 933 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 LAMP1P11279 417 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PDX1P52945 283 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 C21orf58P58505 322 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 OLR1P78380 273 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 TGM3Q08188 693 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SPIDRQ14159 915 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PHF19Q5T6S3 580 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 STPG1Q5TH74 334 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 NLNQ9BYT8 704 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 FGF21Q9NSA1 209 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SLAMF8Q9P0V8 285 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 NDUFAF1Q9Y375 327 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ATP5HO75947 161 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 COX7A2P14406 83 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 NUDT2P50583 147 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 MTTPP55157 894 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PLIN5Q00G26 463 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 STX5Q13190 355 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 RUNX2Q13950 521 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SLC9A5Q14940 896 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ZNF385BQ569K4 471 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ASRGL1Q7L266 308 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 RNF31Q96EP0 1072 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 REEP4Q9H6H4 257 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 C5AR2Q9P296 337 aa22.06■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 CFAP54Q96N23 3096 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PR48 441 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PRMT3O60678 531 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 OR2B3O76000 313 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 FURINP09958 794 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 MMEL1Q495T6 779 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 TSPEARQ8WU66 669 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ADAMTS20P59510 1910 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PCNX2A6NKB5 2137 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 HYKKA2RU49 373 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 FITM1A5D6W6 292 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SGK494L7N484 410 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ANGPT2O15123 496 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 FOXS1O43638 330 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PTPN4P29074 926 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 CLDN6P56747 220 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 KLC1Q07866 573 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 C18orf63Q68DL7 685 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PIP4P1Q86T03 277 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.05■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 GLOD5A6NK44 160 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 TXNDC9O14530 226 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 MRASO14807 208 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SLC34A2O95436 690 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 IL6P05231 212 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 MSL3P1P0C860 447 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ITGAXP20702 1163 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 MNAT1P51948 309 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 WNT3P56703 355 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 MXRA7P84157 204 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PDE7AQ13946 482 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 C16orf72Q14CZ0 275 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 TCTE1Q5JU00 501 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD46Q86W74 232 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 OR52E6Q96RD3 313 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SERINC2Q96SA4 455 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 SH3BP4Q9P0V3 963 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 PROB1E7EW31 1015 aa22.03■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 S100A3P33764 101 aa22.03■■□□□ 1.12
CNN3-202ENST00000394202 ALDH9A1P49189 494 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms