RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 SLC35A5Q9BS91 424 aa23.13■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ABCG4Q9H172 646 aa23.13■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ANKMY1Q9P2S6 941 aa23.13■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 C19orf67A6NJJ6 358 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 C2orf74A8MZ97 194 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SERPINA1P01009 418 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 NTRK1P04629 796 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FAM58BPP0C7Q3 252 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 CKMT2P17540 419 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 IL1RNP18510 177 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 MAOBP27338 520 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 TSFMP43897 325 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FOLH1Q04609 750 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FBXO42Q6P3S6 717 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM40Q6P9F5 258 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 VN1R4Q7Z5H5 301 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 YY1AP1Q9H869 796 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 RAB26Q9ULW5 256 aa23.12■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 TLR4O00206 839 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 AXIN1O15169 862 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 PRKD3O94806 890 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 LDLRP01130 860 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 MT-ND1P03886 318 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 NME1P15531 152 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SLC9A5Q14940 896 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SPACA7Q96KW9 195 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SLC29A1Q99808 456 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM4Q9C037 500 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 KLK4Q9Y5K2 254 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 PDPK1O15530 556 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FKBP9O95302 570 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 DRD2P14416 443 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 MVDP53602 400 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 HHEXQ03014 270 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 MED21Q13503 144 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 NRF1Q16656 503 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SLC5A12Q1EHB4 618 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 PPP4R4Q6NUP7 873 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FIGLAQ6QHK4 219 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SPESP1Q6UW49 350 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 TMEM26Q6ZUK4 368 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 EID3Q8N140 333 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 OR8K5Q8NH50 307 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 NT5CQ8TCD5 201 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SLC47A1Q96FL8 570 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF597Q96LX8 424 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FCRL4Q96PJ5 515 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 TAS2R7Q9NYW3 318 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 AK5Q9Y6K8 562 aa23.11■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SAC3D1A6NKF1 404 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FRKP42685 505 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SLAMF1Q13291 335 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 VEZF1Q14119 521 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ELOCQ15369 112 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 NKG7Q16617 165 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FCRL6Q6DN72 434 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ASPGQ86U10 573 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 EPHX4Q8IUS5 362 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ACOT4Q8N9L9 421 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 OR52N2Q8NGI0 321 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 OR5P2Q8WZ92 322 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 HSPA12BQ96MM6 686 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 C9orf16Q9BUW7 83 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FAIM2Q9BWQ8 316 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 MAGIXQ9H6Y5 334 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 TM9SF3Q9HD45 589 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SLAMF7Q9NQ25 335 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 GPATCH2Q9NW75 528 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 HRASLS2Q9NWW9 162 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 EHD3Q9NZN3 535 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.1■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 B4DGG1 531 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 CLOCKO15516 846 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 CXCL12P48061 93 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 RGS1Q08116 209 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 TGM3Q08188 693 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 FAM180BQ6P0A1 224 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 SLC36A4Q6YBV0 504 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 PACRGLQ8N7B6 248 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 OR2A5Q96R48 311 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 BDH2Q9BUT1 245 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 Q9H521 79 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 C5AR2Q9P296 337 aa23.09■■□□□ 1.29
SERF1A-202ENST00000354833 OAZ3Q9UMX2 235 aa23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms