RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 EXD3Q8N9H8 876 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RIT1Q92963 219 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMCO6Q96DC7 493 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ALG14Q96F25 216 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ECSITQ9BQ95 431 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPR87Q9BY21 358 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C14orf105Q9NVL8 296 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR51B4Q9Y5P0 310 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SHROOM3Q8TF72 1996 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PR77 199 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GABRR3A8MPY1 467 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MCIDASD6RGH6 385 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SCDO00767 359 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GREM1O60565 184 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 WDPCPO95876 746 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 JUNP05412 331 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 LIFP15018 202 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CCR7P32248 378 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RORAP35398 523 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRR5P85299 388 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PWP1Q13610 501 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NCF4Q15080 339 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KRT73Q86Y46 540 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 CLMPQ9H6B4 373 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 SNX15Q9NRS6 342 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UPB1Q9UBR1 384 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 PTPRSQ13332 1948 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 H0Y3Z8 333 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC28A1O00337 649 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 CAPN1P07384 714 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 NUDT17P0C025 328 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CD1CP29017 333 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNC1P48547 511 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DMPKQ09013 629 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 COL19A1Q14993 1142 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MEP1AQ16819 746 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CPTPQ5TA50 214 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MTFR2Q6P444 385 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MEIOBQ8N635 442 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR11G2Q8NGC1 345 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR5K2Q8NHB8 316 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SARAFQ96BY9 339 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJA3Q96EY1 480 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNC2Q96PR1 638 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CDK15Q96Q40 435 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf50Q9BV19 199 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RNF121Q9H920 327 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EBF2Q9HAK2 575 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ16Q9NPI9 418 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ADA2Q9NZK5 511 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TCFL5Q9UL49 500 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C21orf140B9A014 251 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 H3BQF6 201 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TP73O15350 636 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HCRTR2O43614 444 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NR1D1P20393 614 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ACP1P24666 158 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPX6P59796 221 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SSPNQ14714 243 aa4.22□□□□□ -1.73
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