RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 BPIFB3P59826 476 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 WASHC5Q12768 1159 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM187Q14656 261 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 STX1AQ16623 288 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CNSTQ6PJW8 725 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CCNYQ8ND76 341 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 EXOC6Q8TAG9 804 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ABCG8Q9H221 673 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 DPEP3Q9H4B8 488 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SYTL2Q9HCH5 934 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 BICDL2A1A5D9 508 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ANHXE9PGG2 379 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SLC28A1O00337 649 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SURF4O15260 269 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 B4GAT1O43505 415 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SEC22BO75396 215 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PRDM1O75626 825 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 MMP12P39900 470 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 BACE1P56817 501 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 IL1RL1Q01638 556 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PDK1Q15118 436 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KRT31Q15323 416 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 C3AR1Q16581 482 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PARP10Q53GL7 1025 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KLHL22Q53GT1 634 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 Q6ZVQ6 151 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ATP8B4Q8TF62 1192 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CDHR1Q96JP9 859 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ERGIC2Q96RQ1 377 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ODF2LQ9ULJ1 636 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 OR1A2Q9Y585 309 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KRT87PA6NCN2 255 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CCDC69A6NI79 296 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NR5A2O00482 541 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ATP6V1G1O75348 118 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 REC8O95072 547 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 MMP10P09238 476 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ANPEPP15144 967 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 AREGP15514 252 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CYP3A5P20815 502 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 C4BPBP20851 252 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 GIFP27352 417 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 HLA-FP30511 346 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SLC6A12P48065 614 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PITPNBP48739 271 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 EVCP57679 992 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KCNK10P57789 538 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 HLA-BQ31612 363 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 EPC2Q52LR7 807 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CES4AQ5XG92 561 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 RUNDC3BQ96NL0 473 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM245Q9H330 911 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 FGF22Q9HCT0 170 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PIGVQ9NUD9 493 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.2 ms