RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 KDELR2P33947 212 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 CHN2P52757 468 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 ADPRMQ3LIE5 342 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM35AQ53FP2 167 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 PAQR7Q86WK9 346 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 TRIML2Q8N7C3 387 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD9Q8NBP5 474 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 TMBIM1Q969X1 311 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 GSDMCQ9BYG8 508 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 MAGIXQ9H6Y5 334 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF639Q9UID6 485 aa21.66■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 CST1P01037 141 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 VIPP01282 170 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SOAT1P35610 550 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf61Q13536 156 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD2AQ8NA29 543 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 OR10G6Q8NH81 332 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A18Q96BI1 424 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 OR2A14Q96R47 310 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 OR6C74A6NCV1 312 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 IL1RNP18510 177 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 VEZF1Q14119 521 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 EID3Q8N140 333 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 OR8K5Q8NH50 307 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA9Q9BWV2 254 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 CXorf36Q9H7Y0 433 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 CPNE7Q9UBL6 633 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 DPPA5A6NC42 116 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 ZW10O43264 779 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 FOSL2P15408 326 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 GSTM2P28161 218 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 IST1P53990 364 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 VAC14Q08AM6 782 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 KIR2DS3Q14952 304 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD17CQ6PCB6 329 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 TAF8Q7Z7C8 310 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 OR52N2Q8NGI0 321 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM7Q9NQW5 492 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB9Q9UBS3 223 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.64■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 GSAPA4D1B5 854 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 A6NHS1 94 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PDPK1O15530 556 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TBX19O60806 448 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FAM58BPP0C7Q3 252 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 UGT2B7P16662 529 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MAGP20916 626 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 RNF130Q86XS8 419 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TWSG1Q9GZX9 223 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.64■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 WASHC1A8K0Z3 465 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PLOD2O00469 737 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF21O75509 655 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CTSEP14091 401 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 AQP1P29972 269 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 STARD6P59095 220 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 RAB8AP61006 207 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SPIDRQ14159 915 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 OR2L5Q8NG80 312 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SLC37A2Q8TED4 501 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TFAP2CQ92754 450 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 KCNC2Q96PR1 638 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 POT1Q9NUX5 634 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ACTR10Q9NZ32 417 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 USP34Q70CQ2 3546 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 GSTM5P46439 218 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CRYBA2P53672 197 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MANFP55145 182 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SLAMF1Q13291 335 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 VN1R4Q7Z5H5 301 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CARM1Q86X55 608 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SIX5Q8N196 739 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ACOT4Q8N9L9 421 aa21.63■■□□□ 1.05
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