RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SPEF1Q9Y4P9 236 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PCP4L1A6NKN8 68 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 VAMP2P63027 116 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FDXRP22570 491 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SHMT2P34897 504 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 OR4K14Q8NGD5 310 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 STATHP02808 62 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GP1BBP13224 206 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCDQ05655 676 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TRAM1Q15629 374 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TMIEQ8NEW7 156 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GLYATL1Q969I3 302 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RTP4Q96DX8 246 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LTN1O94822 1766 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF878C9JN71 531 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LRRN3E7EW58 273 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LDB2O43679 373 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CSTBP04080 98 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 JUPP14923 745 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 AGXTP21549 392 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HRH2P25021 359 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf40Q86WS4 652 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FIZ1Q96SL8 496 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 XKRXQ6PP77 449 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 IRF7Q92985 503 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TIGARQ9NQ88 270 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LIPT1Q9Y234 373 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 C9J4A7 227 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GSRP00390 522 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 DEFA5Q01523 94 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF550Q7Z398 422 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 NRROSQ86YC3 692 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB11Q9Y547 144 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 H7BY64 318 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF623O75123 536 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B1P14061 328 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 VAMP1P23763 118 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF8Q969P0 613 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 VILLO15195 856 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 BEST1O76090 585 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GABARAPL2P60520 117 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 IRF5Q13568 498 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF181Q2M3W8 571 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 BIRC8Q96P09 236 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GMLQ99445 158 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALT2O60909 372 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ADH1BP00325 375 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PTGS2P35354 604 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CHAF1BQ13112 559 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SGCBQ16585 318 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 EOGTQ5NDL2 527 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LCN8Q6JVE9 175 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FANK1Q8TC84 345 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RELTQ969Z4 430 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 AIFM2Q9BRQ8 373 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CELP19835 753 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms