RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NF1P21359 2839 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ESPL1Q14674 2120 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A096LPI6 279 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SERTM1A2A2V5 107 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 EVPLLA8MZ36 301 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7A17O14581 309 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TPST1O60507 370 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRMT3O60678 531 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJB5O75953 348 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO1DO94832 1006 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CD160O95971 181 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ASLP04424 464 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 JMJD7P0C870 316 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 G6PDP11413 515 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF30P17039 623 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BPIP17213 487 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GGT1P19440 569 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 AKT2P31751 481 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT1P36639 197 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DCTP40126 519 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPC1P48995 793 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH3A2P51648 485 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGDIAP52565 204 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPK10P53779 464 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PNLIPRP1P54315 467 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD23AP54725 363 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MLLT10P55197 1068 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ABRQ12979 859 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBA3CQ13748 450 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DAG1Q14118 895 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF7Q14155 803 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FZD2Q14332 565 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEA2Q15560 299 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNA6Q15825 494 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RABL3Q5HYI8 236 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZSR6 202 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ATCAYQ86WG3 371 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 APCDD1Q8J025 514 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 EID3Q8N140 333 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2T12Q8NG77 320 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2T11Q8NH01 316 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM162AQ96A26 154 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG14Q96F25 216 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SCRN2Q96FV2 425 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPHS2Q99611 448 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CHID1Q9BWS9 393 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTR8Q9H981 624 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PARVBQ9HBI1 364 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PREBQ9HCU5 417 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 KLQ9UEF7 1012 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF639Q9UID6 485 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF225Q9UK10 706 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BAG5Q9UL15 447 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms