RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALX3O95076 343 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 INHAP05111 366 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIE1P35590 1138 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ETV6P41212 452 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSNK1DP48730 415 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRIM2P49643 509 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC74AQ0VAA2 488 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOGQ13253 232 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCARB2Q14108 478 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 VEZF1Q14119 521 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADGRF1Q5T601 910 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PGBD3Q8N328 593 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 DTX3Q8N9I9 347 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC32Q9BV29 185 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 RDH14Q9HBH5 336 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CREBZFQ9NS37 354 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMCC2O75069 709 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD72P21854 359 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOAT1P35610 550 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPAM1P38567 509 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 MVDP53602 400 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDC42P60953 191 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.842e-6■■■□□ 18.8
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPAT3Q53EU6 434 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASIC4Q96FT7 647 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 MIXL1Q9H2W2 232 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PQY0 241 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 GADD45GO95257 159 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSF3P09919 207 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRYBB2P43320 205 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIR2DL3P43628 341 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC6A12P48065 614 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 OLR1P78380 273 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAE1Q13564 534 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 DUSP7Q16829 419 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 WFDC6Q9BQY6 131 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC182A6NF36 153 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 MGAT4DA6NG13 374 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 B4DXG7 233 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANXA8P13928 327 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYL9P24844 172 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 OPRD1P41143 372 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSPHP78330 225 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLD1Q13393 1074 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRSS53Q2L4Q9 553 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PYDC2Q56P42 97 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 OLIG3Q7RTU3 272 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SGK2Q9HBY8 427 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 H3BN98 237 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 IDSP22304 550 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDH18Q13634 790 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDKN3Q16667 212 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 HECTD3Q5T447 861 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 MLIPQ5VWP3 458 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAGAPQ8N103 731 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCAMP4Q969E2 229 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 GDF15Q99988 308 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMX3A6NHT5 357 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CENPBD1B2RD01 187 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLK4O00444 970 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCGF2P35227 344 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASB11Q8WXH4 323 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNAPC3Q92966 411 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRELD1Q96HD1 420 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCLYQ96I15 445 aa20.3■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASAH2Q9NR71 780 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms