RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CASP3	P42574	277 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SLC1A3	P43003	542 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	BTG1	P62324	171 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SLC34A1	Q06495	639 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CNTN1	Q12860	1018 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CEACAM7	Q14002	265 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RCN2	Q14257	317 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NECTIN1	Q15223	517 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MAPK11	Q15759	364 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	STXBP2	Q15833	593 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ACKR1	Q16570	336 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C2CD6	Q53TS8	623 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	KCTD11	Q693B1	232 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM270	Q6UE05	265 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ASPG	Q86U10	573 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RNF149	Q8NC42	400 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SEPT8	Q92599	483 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C11orf52	Q96A22	123 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SLC35C1	Q96A29	364 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	AP2M1	Q96CW1	435 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CUEDC2	Q9H467	287 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SPG21	Q9NZD8	308 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		2.58	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SMIM30	A4D0T7	59 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SHISA7	A6NL88	538 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ANHX	E9PGG2	379 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TNFSF12	O43508	249 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IDH3B	O43837	385 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SNAP91	O60641	907 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	AKAP3	O75969	853 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GAS8-AS1	O95177	125 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FGF19	O95750	216 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CGA	P01215	116 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ACKR3	P25106	362 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GIF	P27352	417 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OR1D2	P34982	312 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	COPB2	P35606	906 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	EVC	P57679	992 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	DHODH	Q02127	395 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FAM189A2	Q15884	450 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	AARD	Q4LEZ3	155 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LAX1	Q8IWV1	398 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SLC43A2	Q8N370	569 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		Q8NBF4	154 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SMPDL3A	Q92484	453 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	AGAP4	Q96P64	663 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PKP2	Q99959	881 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	THEG	Q9P2T0	379 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		2.57	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		A0A0J9YWU9	116 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PRV1	198 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM129	A0AVI4	362 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		A8MU76	341 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2

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