RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 A6NL46 340 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 PLIN3O60664 434 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ALOX12BO75342 701 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SH3BGRLO75368 114 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SUPT7LO94864 414 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 MLYCDO95822 493 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 HPP00738 406 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TGFB1P01137 390 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 FHP07954 510 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TSPAN8P19075 237 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ITGA3P26006 1051 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CERS1P27544 350 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SSR2P43308 183 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CCL11P51671 97 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 PGDP52209 483 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 MTTPP55157 894 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CDH13P55290 713 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CLCQ05315 142 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SLC18A2Q05940 514 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 LCP2Q13094 533 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 IFT88Q13099 833 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CHSY3Q70JA7 882 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CA13Q8N1Q1 262 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SMIM10Q96HG1 83 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 F2RL3Q96RI0 385 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SERINC2Q96SA4 455 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SMC6Q96SB8 1091 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ZNF382Q96SR6 550 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 NTMT1Q9BV86 223 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 GPR83Q9NYM4 423 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TRPS1Q9UHF7 1281 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 A0A1W2PQ72 361 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CCDC151A5D8V7 595 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 G3V2L1 256 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 MASP2O00187 686 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 B4GALT2O60909 372 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 PRB1P04280 392 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 ALPPP05187 535 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 COX6A1P12074 109 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CPA3P15088 417 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 IMPDH1P20839 514 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 EFNA3P52797 238 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RAB38P57729 211 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 NFATC3Q12968 1075 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RAPSNQ13702 412 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RCN2Q14257 317 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 UNC50Q53HI1 259 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CFAP157Q5JU67 520 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 FRG2Q64ET8 278 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 TMEM205Q6UW68 189 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 SHISA5Q8N114 240 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 GALNT16Q8N428 558 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 RNF175Q8N4F7 328 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-214ENST00000625905 BANPQ8N9N5 519 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms