RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TRIM40Q6P9F5 258 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 IGFL2Q6UWQ7 119 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD37Q7Z713 158 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 OR7G3Q8NG95 312 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 QRFPRQ96P65 431 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 RBCK1Q9BYM8 510 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ADGRE2Q9UHX3 823 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SHANK1Q9Y566 2161 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SMIM24O75264 130 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ICAM2P13598 275 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 AP2B1P63010 937 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ABRAXAS2Q15018 415 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 COLEC12Q5KU26 742 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ABHD17CQ6PCB6 329 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CA13Q8N1Q1 262 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TMEM151AQ8N4L1 468 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PNPLA2Q96AD5 504 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MS4A8Q9BY19 250 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 FLNCQ14315 2725 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CD97P48960 835 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TGM3Q08188 693 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 NSDHLQ15738 373 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SLC6A19Q695T7 634 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 QSOX2Q6ZRP7 698 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ACMSDQ8TDX5 336 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MZB1Q8WU39 189 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PSMF1Q92530 271 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PHF21BQ96EK2 531 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TRIM4Q9C037 500 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 IPPKQ9H8X2 491 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ACTR8Q9H981 624 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PPCSQ9HAB8 311 aa23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SBK3P0C264 359 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PLA2G16P53816 162 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ZADH2Q8N4Q0 377 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 L3MBTL4Q8NA19 623 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 F2RL3Q96RI0 385 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SERINC2Q96SA4 455 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa23.42■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 A0A0G2JN53 185 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 H0YIV9 168 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 B3GALT2O43825 422 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PCNAP12004 261 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PIK3CBP42338 1070 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 RUNX2Q13950 521 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TMEM35AQ53FP2 167 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CRB2Q5IJ48 1285 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PLAG1Q6DJT9 500 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ISLR2Q6UXK2 745 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 Q8NA96 180 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TSLPQ969D9 159 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CMTM7Q96FZ5 175 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 KCNC2Q96PR1 638 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 LMF1Q96S06 567 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MFRPQ9BY79 579 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ROGDIQ9GZN7 287 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PRDM7Q9NQW5 492 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 RELNP78509 3460 aa23.41■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PRMT3O60678 531 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 B4GALT2O60909 372 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SOX11P35716 441 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MTTPP55157 894 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CHSY3Q70JA7 882 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PPP4R1Q8TF05 950 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TBCDQ9BTW9 1192 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 EPS8L2Q9H6S3 715 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PCTPQ9UKL6 214 aa23.4■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 WISP1O95388 367 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SHBGP04278 402 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CELA2AP08217 269 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 RAB38P57729 211 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MFAP5Q13361 173 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SFT2D3Q587I9 215 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 Q6ZS92 163 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 UBE3DQ7Z6J8 389 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TDRPQ86YL5 185 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 HUS1BQ8NHY5 278 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 REPS1Q96D71 796 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PTCHD1Q96NR3 888 aa23.39■■□□□ 1.34
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