RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602698.5

HCG18-247, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-247ENST00000602698 CYP4X1Q8N118 509 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MARVELD3Q96A59 401 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 GPR137Q96N19 417 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 RHBGQ9H310 441 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 WHRNQ9P202 907 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 LRFN1Q9P244 771 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TACC2O95359 2948 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 A0A0G2JN53 185 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 LRIT2A6NDA9 550 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 FAM187AA6NFU0 413 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TAPBPO15533 448 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 NME2P1O60361 137 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MLYCDO95822 493 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CCDC166P0CW27 439 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CD1DP15813 335 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 NME2P22392 152 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 GGT5P36269 586 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CASP6P55212 293 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MLF1P58340 268 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CALCOCO2Q13137 446 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ART3Q13508 389 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TERF2Q15554 542 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 C3AR1Q16581 482 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MTFR2Q6P444 385 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 RPTNQ6XPR3 784 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 SIAH3Q8IW03 269 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 KRT78Q8N1N4 520 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 PDPRQ8NCN5 879 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CCT6BQ92526 530 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CDKL2Q92772 493 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MAGED4Q96JG8 741 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 FAR2Q96K12 515 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 QRFPRQ96P65 431 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 GPR22Q99680 433 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 RBBP8Q99708 897 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CPNE1Q99829 537 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ERP44Q9BS26 406 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 DPH5Q9H2P9 285 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 EHD1Q9H4M9 534 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 NT5DC2Q9H857 520 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 WWOXQ9NZC7 414 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 METRNQ9UJH8 293 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TINAGQ9UJW2 476 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 A0A088AWK7 358 aa8.94□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.94□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.94□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 FAM159BA6NKW6 160 aa8.94□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 A8MUA0 341 aa8.94□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.94□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.94□□□□□ -0.98
HCG18-247ENST00000602698 FCHO1O14526 889 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms