RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNDBP1O95273 360 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL3P39023 403 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARSFP54793 590 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CYBRD1Q53TN4 286 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 LAS2Q8IYD9 372 aa24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-204ENST00000587718 GPX2P18283 190 aa24.36■■□□□ 1.49
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CAPNS1-204ENST00000587718 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMBIM1Q969X1 311 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-204ENST00000587718 CAAP1Q9H8G2 361 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-204ENST00000587718 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-204ENST00000587718 FPGTO14772 594 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDH8O95206 1070 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 THRBP10828 461 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V1B1P15313 513 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
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