RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ANKDD1BA6NHY2 528 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 KRT38O76015 456 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 RNH1P13489 461 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 GFAPP14136 432 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 MAOAP21397 527 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 UQCRFS1P47985 274 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PLA2G16P53816 162 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PLAG1Q6DJT9 500 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ABHD17CQ6PCB6 329 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 CATSPER1Q8NEC5 780 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 OR2L5Q8NG80 312 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 LMF1Q96S06 567 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PLA2G3Q9NZ20 509 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 NTNG1Q9Y2I2 539 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 IKBKGQ9Y6K9 419 aa19.62■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 JAK1P23458 1154 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 CERS1P27544 350 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 LAPTM5Q13571 262 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP19.61■□□□□ 0.739e-14■■■□□ 15.6
CS-222ENST00000550996 PAGE2BQ5JRK9 111 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 KLC3Q6P597 504 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 QSOX2Q6ZRP7 698 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 TAOK1Q7L7X3 1001 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 LAS2Q8IYD9 372 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 RNF175Q8N4F7 328 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 TMEM52Q8NDY8 209 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 OR7G3Q8NG95 312 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 MS4A8Q9BY19 250 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 EPS8L2Q9H6S3 715 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 NECTIN3Q9NQS3 549 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 XPR1Q9UBH6 696 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 CLDN16Q9Y5I7 305 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 TGFBR3LH3BV60 316 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PRMT3O60678 531 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SBK3P0C264 359 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 EPB42P16452 691 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 CNTFP26441 200 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 BTBD16Q32M84 506 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 GRHL2Q6ISB3 625 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ZNF793Q6ZN11 406 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 IQCKQ8N0W5 287 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 TMEM151AQ8N4L1 468 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 DNAJB14Q8TBM8 379 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 CNDP1Q96KN2 507 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PTCHD1Q96NR3 888 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PRDM7Q9NQW5 492 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ASF1BQ9NVP2 202 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 E2F3O00716 465 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SH3BGRLO75368 114 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 F10P00742 488 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ICAM2P13598 275 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 GNLYP22749 145 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 OR4D2P58180 307 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SLC29A2Q14542 456 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 FCRLBQ6BAA4 426 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 MED27Q6P2C8 311 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 ADGRD1Q6QNK2 874 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SCUBE1Q8IWY4 988 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 EFCAB3Q8N7B9 438 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 GALNT11Q8NCW6 608 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 FAR2Q96K12 515 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 CSF3RQ99062 836 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 NPAS2Q99743 824 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 SCN2AQ99250 2005 aa19.58■□□□□ 0.73
CS-222ENST00000550996 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 CLEC18AA5D8T8 446 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 TCP11X1B4DZS4 312 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 RTCAO00442 366 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 B3GALT2O43825 422 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 MAN1A2O60476 641 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 RBP1P09455 135 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 PCNAP12004 261 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 COL6A2P12110 1019 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 GTF2H2Q13888 395 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CS-222ENST00000550996 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
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