RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 MYO1DO94832 1006 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 SMIM10L1P0DMW3 83 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 CHRNB4P30926 498 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 PGGT1BP53609 377 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 REEP5Q00765 189 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 GPATCH11Q8N954 259 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 SMIM10Q96HG1 83 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 AIF1LQ9BQI0 150 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 PELI2Q9HAT8 420 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 BTN3A2P78410 334 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 PAOXQ6QHF9 649 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 NXPE4Q6UWF7 544 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 TMPRSS11BQ86T26 416 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 RPRMLQ8N4K4 120 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 VMP1Q96GC9 406 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 FAR2Q96K12 515 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 CCDC77Q9BR77 488 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-214ENST00000548849 C4orf51C9J302 202 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 BANF1O75531 89 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TOXO94900 526 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TTC4O95801 387 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SERPINA6P08185 405 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 IGFBP2P18065 325 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SAT1P21673 171 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SSR4P51571 173 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PLGLB1Q02325 96 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PMPCAQ10713 525 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NCLNQ969V3 563 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF559Q9BR84 538 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 VWA7Q9Y334 891 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HCFC1P51610 2035 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 A0A0G2JN53 185 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 A8MVJ9 347 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZFAND5O76080 213 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TUBB4AP04350 444 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CD1EP15812 388 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ART1P52961 327 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TERF2Q15554 542 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CYP1B1Q16678 543 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CERS2Q96G23 380 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PBKQ96KB5 322 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 AICDAQ9GZX7 198 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 DEPPQ9NTK1 212 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HPF1Q9NWY4 346 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PINLYPA6NC86 204 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 FAM166BA8MTA8 275 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NPIPA3F8WFD2 350 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CLDN4O14493 209 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NRDCO43847 1150 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 DIAPH2O60879 1101 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 OR2J2O76002 312 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 MSX1P28360 303 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PPP2R1BP30154 601 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GPR143P51810 404 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms