RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540904.1

SNHG1-215, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNHG1, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-215ENST00000540904 UGDHO60701 494 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 GLRA3O75311 464 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 CLDN9O95484 217 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 HPP00738 406 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 ALPPP05187 535 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 FHP07954 510 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 GSTA1P08263 222 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 NUDT17P0C025 328 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 COX6A1P12074 109 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 KRT4P19013 534 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TSPAN8P19075 237 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 JAK1P23458 1154 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 CERS1P27544 350 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 SERPINB1P30740 379 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 CDH13P55290 713 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 HERVK_113P63132 956 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TGM3Q08188 693 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 Q0VFX4 171 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 MYBPC3Q14896 1274 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 RASA2Q15283 850 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 NSDHLQ15738 373 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TMEM35AQ53FP2 167 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 COLEC12Q5KU26 742 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TMEM205Q6UW68 189 aa8.7□□□□□ -1.02
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SNHG1-215ENST00000540904 CHSY3Q70JA7 882 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 REPS1Q96D71 796 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 KCNC2Q96PR1 638 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 MS4A8Q9BY19 250 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 OR51B5Q9H339 312 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 LANCL2Q9NS86 450 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.7□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 A0A1B0GTL3 188 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 H0YIV9 168 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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SNHG1-215ENST00000540904 PRMT3O60678 531 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 SUPT7LO94864 414 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 OTCP00480 354 aa8.69□□□□□ -1.02
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SNHG1-215ENST00000540904 PIK3CBP42338 1070 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 CCT5P48643 541 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 NEK2P51955 445 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 RAP1GDS1P52306 607 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 PRKAA2P54646 552 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 MTTPP55157 894 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 PHEXP78562 749 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 RHAGQ02094 409 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 RUNX2Q13950 521 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 PCOLCEQ15113 449 aa8.69□□□□□ -1.02
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SNHG1-215ENST00000540904 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.69□□□□□ -1.02
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SNHG1-215ENST00000540904 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.69□□□□□ -1.02
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SNHG1-215ENST00000540904 ZNF605Q86T29 641 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.69□□□□□ -1.02
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SNHG1-215ENST00000540904 FAM47BQ8NA70 645 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TEX19Q8NA77 164 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TSLPQ969D9 159 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 QRFPRQ96P65 431 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 TMEM237Q96Q45 408 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 SERINC2Q96SA4 455 aa8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SNHG1-215ENST00000540904 CENPKQ9BS16 269 aa8.69□□□□□ -1.02
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