RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 NDC1Q9BTX1 674 aa21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTS20P59510 1910 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 TXNDC9O14530 226 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDH7O60245 1069 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 RDH16O75452 317 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 MMP21Q8N119 569 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 QRFPRQ96P65 431 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.56■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.56■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 SEMA3DO95025 777 aa21.56■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 FGF5P12034 268 aa21.56■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A7Q9Y694 548 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa21.55■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 B4E171 279 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 C9JVG2 144 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 GCGRP47871 477 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ERVK-8P63133 956 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 EMX2Q04743 252 aa21.55■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 RUNX2Q13950 521 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 PTGR1Q14914 329 aa21.55■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 UCN3Q969E3 161 aa21.55■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 ASPMQ8IZT6 3477 aa21.55■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 WASHC1A8K0Z3 465 aa21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPB8E9PQR5 432 aa21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 LRATO95237 230 aa21.54■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.54■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 MTTPP55157 894 aa21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXL2P58012 376 aa21.53■■□□□ 1.04
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TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 GARNL3Q5VVW2 1013 aa21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 AKAP10O43572 662 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 MAPK12P53778 367 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 TAS2R50P59544 299 aa21.52■■□□□ 1.04
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