RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TOX	O94900	526 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B2	P37059	387 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RFC3	P40938	356 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MEOX1	P50221	254 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	DGKQ	P52824	942 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA8	P53708	1063 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PNLIPRP1	P54315	467 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4D2	P58180	307 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PMPCA	Q10713	525 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC6	Q86X45	466 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	LGI4	Q8N135	537 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM136A	Q96C01	138 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NPAS2	Q99743	824 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SYCE3	A1L190	88 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FCHO1	O14526	889 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PFDN6	O15212	129 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRM3	P20309	590 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN7	P35236	360 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL6	P41182	706 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A5	P58743	744 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ABAT	P80404	500 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SPA17	Q15506	151 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF425	Q6IV72	752 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	AADACL2	Q6P093	401 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GK5	Q6ZS86	529 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX11G	Q96HA9	241 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511		Q96M66	194 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF778	Q96MU6	729 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PWWP2A	Q96N64	755 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TFR2	Q9UP52	801 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA4	P78363	2273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511		E5RI56	91 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511		H7BY64	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJA2	O60884	412 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RDH16	O75452	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNB1	P01574	187 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	IMPDH2	P12268	514 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TFEB	P19484	476 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FMO4	P31512	558 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ACVR1	Q04771	509 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	LTB	Q06643	244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TFF3	Q07654	80 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CNGA4	Q8IV77	575 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TSLP	Q969D9	159 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PANX2	Q96RD6	677 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PKP4	Q99569	1192 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY12	Q9H244	342 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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