RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 GPR137Q96N19 417 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 IL17FQ96PD4 163 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SNX15Q9NRS6 342 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PDE10AQ9Y233 779 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 NOTCH1P46531 2555 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf74A8MZ97 194 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 MYO1CO00159 1063 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CDC7O00311 574 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 DYRK3O43781 588 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ZBTB14O43829 449 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RASAL1O95294 804 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RAF1P04049 648 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 C2P06681 752 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TUBBP07437 444 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC166P0CW27 439 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CD1DP15813 335 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 MMP11P24347 488 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PKLRP30613 574 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SLCO1A2P46721 670 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 KCNC1P48547 511 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RGS4P49798 205 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINB9P50453 376 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 IL2P60568 153 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 OR4D1Q15615 310 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SHEQ5VZ18 495 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SPESP1Q6UW49 350 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TDRPQ86YL5 185 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 NACC2Q96BF6 587 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 GPR78Q96P69 363 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PKP4Q99569 1192 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 DERL2Q9GZP9 239 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 POLG2Q9UHN1 485 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RNF6Q9Y252 685 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ASB1Q9Y576 335 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 A0A096LPK6 155 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1W2PPM1 405 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1W2PPV9 198 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC151A5D8V7 595 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM23A6NLE4 172 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RASGRF2O14827 1237 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SLC16A5O15375 505 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SLC16A8O95907 504 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CATP04040 527 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RPN2P04844 631 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 C8GP07360 202 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CD63P08962 238 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 EPXP11678 715 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 UGT2B7P16662 529 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms