RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 URADA6NGE7 173 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SGK494L7N484 410 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 RDH16O75452 317 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 KLHL18O94889 574 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR47O94967 919 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SERPIND1P05546 499 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PRR35P0CG20 571 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 FOSL1P15407 271 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CD1DP15813 335 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GNAZP19086 355 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 AHRP35869 848 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 XCR1P46094 333 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC6A12P48065 614 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB10P61026 200 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP6V0D1P61421 351 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 AP2B1P63010 937 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SKP1P63208 163 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GUCY2DQ02846 1103 aa6.05□□□□□ -1.44
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CTDSPL-208ENST00000486978 CDC16Q13042 620 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SLMAPQ14BN4 828 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
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CTDSPL-208ENST00000486978 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM205Q6UW68 189 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PDSS2Q86YH6 399 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GPSM1Q86YR5 675 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 AMER2Q8N7J2 671 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MNS1Q8NEH6 495 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TRPV3Q8NET8 790 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NT5CQ8TCD5 201 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF592Q92610 1267 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 OR1F2PQ96R84 312 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 WWOXQ9NZC7 414 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.05□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CLGNO14967 610 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TAPBPO15533 448 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CLDN14O95500 239 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBB4AP04350 444 aa6.04□□□□□ -1.44
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CTDSPL-208ENST00000486978 SERPINA6P08185 405 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ICAM2P13598 275 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ALOX12P18054 663 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TFEBP19484 476 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 IL10P22301 178 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GSTM2P28161 218 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CRABP2P29373 138 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PHBP35232 272 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SOX11P35716 441 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GGT5P36269 586 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GDF5P43026 501 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 AGTR2P50052 363 aa6.04□□□□□ -1.44
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