RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 POMT2Q9UKY4 750 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NEU3Q9UQ49 428 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TRBC2A0A5B9 178 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SGK494L7N484 410 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 STX16O14662 325 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CD59P13987 128 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CD1DP15813 335 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PNLIPP16233 465 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SERPINB5P36952 375 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 KLC1Q07866 573 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LRRC46Q96FV0 321 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CCT7Q99832 543 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf50Q9BV19 199 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf109Q9NX04 203 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ADA2Q9NZK5 511 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CFAP73A6NFT4 308 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SLAMF1Q13291 335 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TRABD2AQ86V40 505 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 RELL1Q8IUW5 271 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 VRK3Q8IV63 474 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 EBPLQ9BY08 206 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SVILO95425 2214 aa8.85□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 A8MVJ9 347 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 B4GAT1O43505 415 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 IMPDH1P20839 514 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 AGTR2P50052 363 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TMPRSS3P57727 454 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SH3BP2P78314 561 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SPIN4Q56A73 249 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 EID3Q8N140 333 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 FAM47BQ8NA70 645 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 MDM1Q8TC05 714 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 HPF1Q9NWY4 346 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PLLPQ9Y342 182 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 VWA8A3KMH1 1905 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 A8MT66 165 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NR5A2O00482 541 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 P04436 131 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NR2F1P10589 423 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 DRD4P21917 467 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF33BQ06732 778 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 AGKQ53H12 422 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 KRT73Q86Y46 540 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ASB15Q8WXK1 588 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PMM1Q92871 262 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CATSPER2Q96P56 530 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SH3GL1Q99961 368 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 FETUBQ9UGM5 382 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LRRC42Q9Y546 428 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 GLOD5A6NK44 160 aa8.84□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 E9PBE3 544 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms