RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 C4orf51C9J302 202 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PFDN6O15212 129 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AIREO43918 545 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ENTPD6O75354 484 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBP9O95302 570 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CSF3P09919 207 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VAC14Q08AM6 782 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCB1Q12824 385 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EFR3AQ14156 821 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CPXM2Q8N436 756 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF32Q9H0A6 362 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ADNPQ9H2P0 1102 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DYRK4Q9NR20 520 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCB8Q9NUT2 735 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN5AQ14524 2016 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQ09 198 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CBX4O00257 560 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FURINP09958 794 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF1BP20333 461 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DL3P43628 341 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RPIAP49247 311 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ELP6Q0PNE2 266 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CSRP2Q16527 193 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LEXMQ3ZCV2 418 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM69Q86WT6 500 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RDH10Q8IZV5 341 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa3.47□□□□□ -1.85
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PGGT1B-203ENST00000419445 OR9Q2Q8NGE9 314 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HUS1BQ8NHY5 278 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF480Q8WV37 535 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3GL1Q99961 368 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SPASTQ9UBP0 616 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FADS2O95864 444 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP17A1P05093 508 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ALPPP05187 535 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SCG5P05408 212 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NSG1P42857 185 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK2BP67870 215 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RHAGQ02094 409 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SP140Q13342 867 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMC12Q5T9G4 340 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SAXO2Q658L1 398 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE3DQ7Z6J8 389 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SETD6Q8TBK2 473 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BTN2A2Q8WVV5 523 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GLMNQ92990 594 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLPBQ9H078 707 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT84Q9NSB2 600 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALT6Q9UBX8 382 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC28Q96AY4 2481 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LTBP2Q14767 1821 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 E7EQ34 232 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC16A5O15375 505 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXS1O43638 330 aa3.46□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 GSTM1P09488 218 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A3P33764 101 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ILKQ13418 452 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MICAQ29983 383 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2AP1Q8NGE2 309 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MARVELD3Q96A59 401 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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