RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412220.1

USP9YP33-201, Transcript of USP9Y pseudogene 33, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP33, Length 421 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP33-201ENST00000412220 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 THEGQ9P2T0 379 aa3.36□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 A0A0J9YWU9 116 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 MAGEB16A2A368 324 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 GLTPD2A6NH11 291 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 G3V2L1 256 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 H0YIG0 161 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 TTI1O43156 1089 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CRCPO75575 148 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 NXPH4O95158 308 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 VCLP18206 1134 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 GIFP27352 417 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 PDHA2P29803 388 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 GPR183P32249 361 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SLC1A3P43003 542 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 LMO4P61968 165 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 FKBP1BP68106 108 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 DHODHQ02127 395 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SLC3A1Q07837 685 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 GPR50Q13585 617 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 LY6DQ14210 128 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SMU1Q2TAY7 513 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 METTL7BQ6UX53 244 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CCDC83Q8IWF9 413 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 NUP93Q8N1F7 819 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 RNF149Q8NC42 400 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 OR5M9Q8NGP3 310 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 AGAP3Q96P47 875 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 AGAP4Q96P64 663 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 PANX3Q96QZ0 392 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 TRIM15Q9C019 465 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CUEDC2Q9H467 287 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 VIPAS39Q9H9C1 493 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ITM2BQ9Y287 266 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ACEP12821 1306 aa3.35□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 TCP10L2B9ZVM9 353 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 LMO7DNF2Z398 122 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SOCS3O14543 225 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 TFECO14948 347 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 IDH3BO43837 385 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 LRCH4O75427 683 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 UROSP10746 265 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 MAGEB1P43366 347 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ERVK-16P61578 105 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CNTN1Q12860 1018 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CEACAM7Q14002 265 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 MAPK11Q15759 364 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 FAM189A2Q15884 450 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ACKR1Q16570 336 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 C2CD6Q53TS8 623 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 Q6ZVQ6 151 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 KCTD9Q7L273 389 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CCDC170Q8IYT3 715 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 METTL4Q8N3J2 472 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SEPT8Q92599 483 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SLC35C1Q96A29 364 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 LGMNQ99538 433 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ZNF559Q9BR84 538 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ACPTQ9BZG2 426 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 TRIM7Q9C029 511 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 PARLQ9H300 379 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 SPG21Q9NZD8 308 aa3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
USP9YP33-201ENST00000412220 CCER2I3L3R5 266 aa3.33□□□□□ -1.88
USP9YP33-201ENST00000412220 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
USP9YP33-201ENST00000412220 P2RX6O15547 441 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms