RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 NAGLUP54802 743 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 PHEXP78562 749 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 PCLAFQ15004 111 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 FAAH2Q6GMR7 532 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 CHSY3Q70JA7 882 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 QRFPRQ96P65 431 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 MID2Q9UJV3 735 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 SCN2AQ99250 2005 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22.52■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 RTCAO00442 366 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 PEX12O00623 359 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 SOCS6O14544 535 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 TYROBPO43914 113 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 POLE2P56282 527 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJB13P59910 316 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 TGM3Q08188 693 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 FRG2Q64ET8 278 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 CROCCP2Q86T23 111 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 CA13Q8N1Q1 262 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 IP6K3Q96PC2 410 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 FRG2BQ96QU4 278 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF382Q96SR6 550 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 MASP2O00187 686 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJB5O75953 348 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 MLYCDO95822 493 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 IGHEP01854 428 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 CERS1P27544 350 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 LCP2Q13094 533 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 RUNX2Q13950 521 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 SGO1Q5FBB7 561 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 LIPMQ5VYY2 423 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 KIRREL2Q6UWL6 708 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 CDYL2Q8N8U2 506 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 TBC1D20Q96BZ9 403 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 C8orf44Q96CB5 159 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 PGM2Q96G03 612 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNC2Q96PR1 638 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ING2Q9H160 280 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 MED13Q9UHV7 2174 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A088AWK7 358 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 AGPSO00116 658 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 B3GALT2O43825 422 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ETHE1O95571 254 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 IFT88Q13099 833 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 LY6DQ14210 128 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 CASP8Q14790 479 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP157Q5JU67 520 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 EXD3Q8N9H8 876 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 NACC2Q96BF6 587 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 OR1F2PQ96R84 312 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 MECRQ9BV79 373 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 LANCL2Q9NS86 450 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM227AF5H4B4 570 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 FHP07954 510 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 IL10P22301 178 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 RAP1GDS1P52306 607 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 MTTPP55157 894 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 MED25Q71SY5 747 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 SERINC2Q96SA4 455 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ATRXP46100 2492 aa22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 B4GALT2O60909 372 aa22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3-202ENST00000410062 ALOX12BO75342 701 aa22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms