RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 MED16Q9Y2X0 877 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 GRID2IPA4D2P6 1211 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 LIASO43766 372 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CEP104O60308 925 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 OR6B1O95007 311 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 TACR1P25103 407 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 GRK3P35626 688 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF750Q32MQ0 723 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 WLSQ5T9L3 541 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 FBXW10Q5XX13 1052 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 FAM109AQ8N4B1 249 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 IL22Q9GZX6 179 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PCBD2Q9H0N5 130 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 RHBGQ9H310 441 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NEUROD4Q9HD90 331 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 B4GALT7Q9UBV7 327 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 MPDZO75970 2070 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PFDN6O15212 129 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 OR1F1O43749 312 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 OR2J2O76002 312 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SERPIND1P05546 499 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 OGNP20774 298 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CNR1P21554 472 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 MGAT1P26572 445 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NPY2RP49146 381 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 MAN2A2P49641 1150 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 GPR143P51810 404 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SEM1Q6ZVN7 128 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 TC2NQ8N9U0 490 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ASB15Q8WXK1 588 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NCLNQ969V3 563 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 VMP1Q96GC9 406 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PDLIM2Q96JY6 352 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 KIFC1Q9BW19 673 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 IL1RL2Q9HB29 575 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SYBUQ9NX95 663 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 AMFRQ9UKV5 643 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 FAM171A2A8MVW0 826 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6AP2O75787 350 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ZFAND5O76080 213 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2R1BP30154 601 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SOX3P41225 446 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 DCAF7P61962 342 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NAE1Q13564 534 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PWP1Q13610 501 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF549Q6P9A3 640 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 AGTRAPQ6RW13 159 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 LCTLQ6UWM7 567 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CPNE9Q8IYJ1 553 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC170Q8IYT3 715 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SARAFQ96BY9 339 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 LDAHQ9H6V9 325 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 BFARQ9NZS9 450 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SPRR3Q9UBC9 169 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 DHRS7Q9Y394 339 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CSPG4Q6UVK1 2322 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SUSD5O60279 629 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 RNH1P13489 461 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NPPBP16860 134 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CD53P19397 219 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 BMP5P22003 454 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 RPL22P35268 128 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 HNF4AP41235 474 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ASCL1P50553 236 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 RAB8AP61006 207 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SKP1P63208 163 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SLC10A1Q14973 349 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 SHEQ5VZ18 495 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 GK5Q6ZS86 529 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CILP2Q8IUL8 1156 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 UBL4BQ8N7F7 174 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NAXEQ8NCW5 288 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 NT5CQ8TCD5 201 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 RASL10BQ96S79 203 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 FAM173AQ9BQD7 235 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC77Q9BR77 488 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 LACRTQ9GZZ8 138 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD12-201ENST00000404162 PAK5Q9P286 719 aa17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms