RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 MMEL1Q495T6 779 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 COQ5Q5HYK3 327 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PAOXQ6QHF9 649 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 METTL4Q8N3J2 472 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 RNF175Q8N4F7 328 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PRRX2Q99811 253 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 SH3GL3Q99963 347 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 DPY30Q9C005 99 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 OR51B5Q9H339 312 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PADI4Q9UM07 663 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 RP1P56715 2156 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 TLCD2A6NGC4 264 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 URADA6NGE7 173 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 B2RBV5 119 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PATE3B3GLJ2 98 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NR5A2O00482 541 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 GYG2O15488 501 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NDUFS4O43181 175 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PCDH7O60245 1069 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 TNFRSF21O75509 655 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 KRT34O76011 436 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ETHE1O95571 254 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 IL6P05231 212 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 KRT16P08779 473 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF883P0CG24 379 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PRPS1L1P21108 318 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 CDH3P22223 829 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NUDT2P50583 147 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NME5P56597 212 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 CLDN8P56748 225 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PWP1Q13610 501 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NR0B2Q15466 257 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 LPAL2Q16609 132 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 SMUG1Q53HV7 270 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 GK5Q6ZS86 529 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NUDT13Q86X67 352 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 PLD3Q8IV08 490 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NAT6Q93015 286 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 RGMAQ96B86 450 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 SPDL1Q96EA4 605 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.12□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 LRIT2A6NDA9 550 aa7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 CCDC154A6NI56 674 aa7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 M0R3H8 397 aa7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 ANKRD28O15084 1053 aa7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 CFLARO15519 480 aa7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 AHCYL1O43865 530 aa7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HIVEP1-202ENST00000399469 NRP2O60462 931 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms