RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF584Q8IVC4 421 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf32Q8N8J7 132 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4Q3Q8NH05 313 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETD6Q8TBK2 473 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAAR6Q96RI8 345 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP1M1Q9BXS5 423 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRCC1Q9C099 1032 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDRG1Q9NUG6 133 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 FER1L5A0AVI2 2057 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLATP10515 647 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC1A3P43003 542 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 EVCP57679 992 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPP38P78345 283 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNTN1Q12860 1018 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC27A4Q6P1M0 643 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 REG3GQ6UW15 175 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf107Q6ZR85 190 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMUB2Q71RG4 321 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCM10Q7L590 875 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADCK1Q86TW2 530 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIT1Q92963 219 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC4Q96A65 974 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 GBP5Q96PP8 586 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS14Q96SY0 518 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR41Q9HAD4 459 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRGBPQ9NV56 204 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 GON4LQ3T8J9 2241 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa2.4□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa2.4□□□□□ -2.02
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0B4J203 849 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GTH9 108 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF840PA6NDX5 716 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MU10 97 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF732B4DXR9 585 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C0S8 307 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7EQG2 157 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHOX2AO14813 284 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDM1O75626 825 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RENP00797 406 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 QDPRP09417 244 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD34CP0C6C1 535 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPY3P0CV98 308 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPY8P0CW00 308 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRD5A2P31213 254 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSK3BP49841 420 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ECSCRQ19T08 205 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MUC21Q5SSG8 566 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA19Q7Z5L4 167 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPAINQ86UA6 219 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CREBRFQ8IUR6 639 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf19Q8IY42 314 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 THNSL1Q8IYQ7 743 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPD1LQ8N335 351 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGFRL1Q8N441 504 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHOXF1Q8NHV9 184 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NABP1Q96AH0 204 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERP27Q96DN0 273 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PINK1Q9BXM7 581 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SP140LQ9H930 580 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEPPQ9NTK1 212 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBQLN2Q9UHD9 624 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GMEB2Q9UKD1 530 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087WWV3 80 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5orf52A6NGY3 159 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERINC4A6NH21 518 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXNL1O43396 289 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCO2O43819 266 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SELENOFO60613 162 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANGPTL1O95841 491 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT-ND1P03886 318 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT3P12035 628 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL9P32969 192 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GP5P40197 560 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR3A1P47881 315 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRELPP51888 382 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEX3P56589 373 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 BACE1P56817 501 aa2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms