RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf51C9J302 202 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TAPBPO15533 448 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CHST10O43529 356 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CDH16O75309 829 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 STK16O75716 305 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 AGFG2O95081 481 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINA6P08185 405 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MYBL2P10244 700 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TFEBP19484 476 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GSTM2P28161 218 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GGT5P36269 586 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HSPA7P48741 367 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TNFSF10P50591 281 aa7.21□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF33BQ06732 778 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HYAL2Q12891 473 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 BMPR2Q13873 1038 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SLC29A2Q14542 456 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RASA2Q15283 850 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NSDHLQ15738 373 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PDK4Q16654 411 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD16Q32M84 506 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SFT2D3Q587I9 215 aa7.21□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 FHL5Q5TD97 284 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MROH9Q5TGP6 573 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TDRPQ86YL5 185 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KRT78Q8N1N4 520 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 AMER2Q8N7J2 671 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SNX31Q8N9S9 440 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TTLQ8NG68 377 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PRR7Q8TB68 274 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CCT6BQ92526 530 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ISL2Q96A47 359 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1191Q96A73 305 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ESAMQ96AP7 390 aa7.21□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 EHD1Q9H4M9 534 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL31Q9H511 634 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SNX15Q9NRS6 342 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NOTCH2Q04721 2471 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 A0A096LPK6 155 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.2□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 CLGNO14967 610 aa7.2□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 B4GALT2O60909 372 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KERAO60938 352 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJB6O75190 326 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SUPT3HO75486 399 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CBX6O95503 412 aa7.2□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 NUDT17P0C025 328 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 FAM153BP0C7A2 387 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3CGP48736 1102 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 OR4D2P58180 307 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 DLG1Q12959 904 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 DOC2AQ14183 400 aa7.2□□□□□ -1.26
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