RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZER1Q7Z7L7 766 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM203Q969S6 136 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SYT3Q9BQG1 590 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTRT3Q9BYD9 372 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRAC1Q9NRG0 131 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 INPP5EQ9NRR6 644 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CPQQ9Y646 472 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ART1P52961 327 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TAS2R20P59543 309 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CCINQ13939 588 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC66Q68CR7 880 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 REEP3Q6NUK4 255 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TAAR8Q969N4 342 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ASAH2Q9NR71 780 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 OGDHQ02218 1023 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CERKQ8TCT0 537 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 BIRC7Q96CA5 298 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF19AQ9NV58 838 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SOHLH2Q9NX45 425 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 AK1P00568 194 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 L1CAMP32004 1257 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 BMXP51813 675 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GDF10P55107 478 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 COQ8BQ96D53 544 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ULBP1Q9BZM6 244 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LIPT1Q9Y234 373 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CDHR4A6H8M9 788 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 IRAK2O43187 625 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS17P08708 135 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 NIPAL3Q6P499 406 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM159BA6NKW6 160 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CXCL11O14625 94 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MATN3O15232 486 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 S1PR1P21453 382 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 IL4RP24394 825 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KLRK1P26718 216 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 IL10RBQ08334 325 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PTERQ96BW5 349 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 APOLD1Q96LR9 279 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 LUZP4Q9P127 313 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 H7C1Q1 480 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBG1P23258 451 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MYRFLQ96LU7 910 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO10Q9UK96 956 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAM2Q15035 370 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF440Q8IYI8 595 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PROKR2Q8NFJ6 384 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 EBPLQ9BY08 206 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MFSD1Q9H3U5 465 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO7Q9Y3I1 522 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A0D9SG52 128 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP2K4P45985 399 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MSANTD2Q6P1R3 559 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR135Q8IZ08 494 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SIAEQ9HAT2 523 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ENPP5Q9UJA9 477 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PIRTP0C851 137 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FRKP42685 505 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CXCR4P61073 352 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 EMX2Q04743 252 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF460Q14592 562 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms