RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 TMEFF1Q8IYR6 380 aa18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 MICU2Q8IYU8 434 aa18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 C1orf216Q8TAB5 229 aa18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 SLC6A16Q9GZN6 736 aa18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 TPT1P8Q9HAU6 139 aa18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18.27■□□□□ 0.52
UPP1-201ENST00000331803 C1orf226A1L170 272 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 OR2A25A4D2G3 310 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 C2orf74A8MZ97 194 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 B4DGG1 531 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 TIPRLO75663 272 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 GPX2P18283 190 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 HBA1P69905 142 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 FBXO42Q6P3S6 717 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 TMEM26Q6ZUK4 368 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SERPINA11Q86U17 422 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 AMER3Q8N944 861 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ZNF570Q96NI8 536 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 HRASLS2Q9NWW9 162 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 THEGQ9P2T0 379 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ANAPC2Q9UJX6 822 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 VPS4AQ9UN37 437 aa18.27■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 A0A0A6YYD5 115 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 CXCR6O00574 342 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ERI3O43414 337 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 C6orf47O95873 294 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ACADSP16219 412 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ATP6V1C1P21283 382 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 MAP7Q14244 749 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 FAM47BQ8NA70 645 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 OR2L5Q8NG80 312 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 LMX1AQ8TE12 382 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 FCRL4Q96PJ5 515 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 KCNC2Q96PR1 638 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PRB8 838 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SCELO95171 688 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 CAPNS1P04632 268 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ALDH9A1P49189 494 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ARFIP1P53367 373 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 DMWDQ09019 674 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SFT2D3Q587I9 215 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 MTX3Q5HYI7 312 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 FIGLAQ6QHK4 219 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SPESP1Q6UW49 350 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 PDSS2Q86YH6 399 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ZFP90Q8TF47 636 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 GMEB1Q9Y692 573 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 C4orf51C9J302 202 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 TBX19O60806 448 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 NXPH1P58417 271 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 GAB1Q13480 694 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SLC9A5Q14940 896 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SLC5A12Q1EHB4 618 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 CMPK2Q5EBM0 449 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 FCRL6Q6DN72 434 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ERMP1Q7Z2K6 904 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 VN1R4Q7Z5H5 301 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 AMIGO2Q86SJ2 522 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 GKN2Q86XP6 184 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 CLEC4FQ8N1N0 589 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 DNASE2BQ8WZ79 361 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 IER2Q9BTL4 223 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ABCG4Q9H172 646 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ANKMY1Q9P2S6 941 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 DOLKQ9UPQ8 538 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.25■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 CTSVO60911 334 aa18.24■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 KCNK5O95279 499 aa18.24■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 FAM58BPP0C7Q3 252 aa18.24■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 PPIBP23284 216 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms