RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 PRIM2P49643 509 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 REEP5Q00765 189 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 RNF130Q86XS8 419 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 NFKBIDQ8NI38 313 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 LHPPQ9H008 270 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PP55 124 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ANGPTL1O95841 491 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 OPN1SWP03999 348 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MATN1P21941 496 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TEAD1P28347 426 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SERPINB1P30740 379 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 KRT75O95678 551 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 RRM2P31350 389 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PBX2P40425 430 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MAPK12P53778 367 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TMBIM6P55061 237 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 NODALQ96S42 347 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 APOL4Q9BPW4 351 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ICKQ9UPZ9 632 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ACP5P13686 325 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 DDCP20711 480 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 GDI1P31150 447 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 IFI44LQ53G44 452 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC80Q76M96 950 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 PAGE2Q7Z2X7 111 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 GAB3Q8WWW8 586 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 TAMM41Q96BW9 452 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 F2RL3Q96RI0 385 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 MYOCQ99972 504 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PPV9 198 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM64BA6NI03 449 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM23P36406 574 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 CDK6Q00534 326 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 PIGFQ07326 219 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 DMPKQ09013 629 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 C2orf27AQ580R0 203 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 LZICQ8WZA0 190 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 NDUFAF4Q9P032 175 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 FEZF1A0PJY2 475 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 RTCAO00442 366 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 ADAMDEC1O15204 470 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 UQCRC2P22695 453 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 BSGP35613 385 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 FGL2Q14314 439 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 NUMA1Q14980 2115 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 MUL1Q969V5 352 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 C12orf66Q96MD2 445 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 MYADMQ96S97 322 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 NT5DC2Q9H857 520 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PPW3 197 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 PTGES3LE9PB15 166 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 H7BY64 318 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 M0QX08 132 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 XPNPEP2O43895 674 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms