RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 INAVAQ3KP66 663 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ARSIQ5FYB1 569 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CRB2Q5IJ48 1285 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A16Q86VW1 577 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 NFKBIDQ8NI38 313 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PPCDCQ96CD2 204 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CRELD1Q96HD1 420 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TCF25Q9BQ70 676 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CPNE5Q9HCH3 593 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 MYNNQ9NPC7 610 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 C1GALT1Q9NS00 363 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 RLIMQ9NVW2 624 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF226Q9NYT6 803 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 C8AP07357 584 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 XPAP23025 273 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TBPL1P62380 186 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PSMA8Q8TAA3 256 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF480Q8WV37 535 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 IRF7Q92985 503 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 MTERF3Q96E29 417 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CORO1BQ9BR76 489 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EPHX3Q9H6B9 360 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 DMRT3Q9NQL9 472 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 WDR37Q9Y2I8 494 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 DYRK1BQ9Y463 629 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 AGAP5A6NIR3 686 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 H3BM21 787 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 C1orf105O95561 183 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 LINC00271P0C7V0 271 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF1BP20333 461 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ARMC8Q8IUR7 673 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 STX19Q8N4C7 294 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 IMPAD1Q9NX62 359 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.83■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TYRP14679 529 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 CA8P35219 290 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 OR1E2P47887 323 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 HMGA2P52926 109 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 CDK6Q00534 326 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 TMEM220Q6QAJ8 160 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 ARMCX6Q7L4S7 300 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 OTOP2Q7RTS6 562 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 OR52J3Q8NH60 311 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 PIP5K1AQ99755 562 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 GPR83Q9NYM4 423 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 DKK3Q9UBP4 350 aa26.82■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 PLK4O00444 970 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 KDM1AO60341 852 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 ADORA3P0DMS8 318 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 PDHA2P29803 388 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 XCR1P46094 333 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 ZNF805Q5CZA5 627 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 SLC30A8Q8IWU4 369 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 SYTL1Q8IYJ3 562 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 HCAR2Q8TDS4 363 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 AMBNQ9NP70 447 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 IL23AQ9NPF7 189 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 TAS2R9Q9NYW1 312 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 IL36AQ9UHA7 158 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 NPPBP16860 134 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 NNMTP40261 264 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 LIMS1P48059 325 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 FPGSQ05932 587 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 IRF3Q14653 427 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 LILRA6Q6PI73 481 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 NRSN1Q8IZ57 195 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 C16orf78Q8WTQ4 265 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 AP2M1Q96CW1 435 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 SAMD11Q96NU1 681 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 SGPP1Q9BX95 441 aa26.81■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 ARRDC5A6NEK1 342 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF25A6NGN4 478 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 STSP08842 583 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 TMED10P49755 219 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 C2orf80Q0P641 193 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 MAPK11Q15759 364 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 FAM71E1Q6IPT2 247 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 LYSMD2Q8IV50 215 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 LRIG1Q96JA1 1093 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 SPHK2Q9NRA0 654 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa26.8■■□□□ 1.88
UBP1-201ENST00000283628 DUSP12Q9UNI6 340 aa26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms