RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270722.9

PRDM16-201, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM16, Length 8,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-201ENST00000270722 GSTM4Q03013 218 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CARD16Q5EG05 197 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TWIST2Q8WVJ9 160 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CD180Q99467 661 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ADAP2Q9NPF8 381 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 NANSQ9NR45 359 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF175Q9Y473 711 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 HHLA1C9JL84 531 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 BUD23O43709 281 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SNX3O60493 162 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.353e-12■■■□□ 15.3
PRDM16-201ENST00000270722 GDI1P31150 447 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SMSP52788 366 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TRAM1Q15629 374 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PKDCCQ504Y2 493 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TRIM61Q5EBN2 209 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 GPR65Q8IYL9 337 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SULT4A1Q9BR01 284 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TLR9Q9NR96 1032 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 LAMTOR5O43504 91 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SEC13P55735 322 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TMEM35AQ53FP2 167 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SCGB1C1Q8TD33 95 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TLR6Q9Y2C9 796 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 BEST1O76090 585 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CBX6O95503 412 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SLC39A4Q6P5W5 647 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SMARCD3Q6STE5 483 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 LAS2Q8IYD9 372 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PGAM4Q8N0Y7 254 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 NXPE1Q8N323 547 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 LILRB4Q8NHJ6 448 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 NCSTNQ92542 709 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 GPR21Q99679 349 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ORAI3Q9BRQ5 295 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TLR10Q9BXR5 811 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SEC61A2Q9H9S3 476 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 FLRT1Q9NZU1 646 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 NPIPA2E9PIF3 369 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 NPIPA3F8WFD2 350 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ALOX15BO15296 676 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 DIRAS1O95057 198 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PTTG1O95997 202 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 DSC3Q14574 896 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ADGRF1Q5T601 910 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 IL23RQ5VWK5 629 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 NRROSQ86YC3 692 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PPM1MQ96MI6 270 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 HES2Q9Y543 173 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 POU4F2Q12837 409 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 RCAN2Q14206 197 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF662Q6ZS27 426 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 OR6K2Q8NGY2 324 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ELP5Q8TE02 316 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 STRA6Q9BX79 667 aa12.85□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ENTPD6O75354 484 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 GADD45GO95257 159 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 BCKDHAP12694 445 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PLA2G16P53816 162 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 GRIK2Q13002 908 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 GNMTQ14749 295 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 C2orf27AQ580R0 203 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 DUSP26Q9BV47 211 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TAS2R9Q9NYW1 312 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 DUX1O43812 170 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 FADS1O60427 444 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PROS1P07225 676 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 AQP1P29972 269 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 NUDT1P36639 197 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CPT1BQ92523 772 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 OSTF1Q92882 214 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CYP4B1P13584 511 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 MMP8P22894 467 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PKLRP30613 574 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CLCQ05315 142 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 IQCHQ86VS3 1027 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 CYP2W1Q8TAV3 490 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 NLGN3Q9NZ94 848 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 TCAF1Q9Y4C2 921 aa12.84□□□□□ -0.35
PRDM16-201ENST00000270722 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms