RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 OR51B5Q9H339 312 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 DMRT3Q9NQL9 472 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TUBD1Q9UJT1 453 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 MKL2Q9ULH7 1088 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PLLPQ9Y342 182 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 DOCK10Q96BY6 2186 aa21.02■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB17A8MXT2 336 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SH3BGRLO75368 114 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 C1QL1O75973 258 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SUPT7LO94864 414 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ETHE1O95571 254 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PRB1P04280 392 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 HEXBP07686 556 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 IL10P22301 178 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB1P30740 379 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CCL11P51671 97 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RHAGQ02094 409 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RBBP7Q16576 425 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PLPP5Q8NEB5 264 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CMTM7Q96FZ5 175 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 APOPT1Q96IL0 206 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RBCK1Q9BYM8 510 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 GSTO2Q9H4Y5 243 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FBXL4Q9UKA2 621 aa21.02■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FAM227AF5H4B4 570 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RTCAO00442 366 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PEX12O00623 359 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ALOX12BO75342 701 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FHP07954 510 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MYL2P10916 166 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SOX8P57073 446 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RPS13P62277 151 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TMEM35AQ53FP2 167 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D20Q96BZ9 403 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 OXSMQ9NWU1 459 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 KCMF1Q9P0J7 381 aa21.01■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 COL6A6A6NMZ7 2263 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CCDC151A5D8V7 595 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SAP18O00422 153 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SPAG7O75391 227 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SCELO95171 688 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 OTCP00480 354 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PDGFAP04085 211 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 COX6A1P12074 109 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CPA3P15088 417 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CERS1P27544 350 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RRADP55042 308 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB13P59910 316 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SKP1P63208 163 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 Q0VFX4 171 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 KRT71Q3SY84 523 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TRIM40Q6P9F5 258 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CHSY3Q70JA7 882 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RDH11Q8TC12 318 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB9Q96C00 473 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FAR2Q96K12 515 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PPT2Q9UMR5 302 aa21■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TYROBPO43914 113 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 OR4F21O95013 312 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CYC1P08574 325 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MTTPP55157 894 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PCOLCEQ15113 449 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FRG2Q64ET8 278 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 LANCL3Q6ZV70 420 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TMEM52Q8NDY8 209 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 REPS1Q96D71 796 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CCDC126Q96EE4 140 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 KCNC2Q96PR1 638 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FRG2BQ96QU4 278 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SERINC2Q96SA4 455 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ZNF382Q96SR6 550 aa20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms