RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628659.2

PCBP1-AS1-331, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 922 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.31□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 C7orf72A4D263 438 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 BTN3A3O00478 584 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 BTN3A1O00481 513 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 FFAR3O14843 346 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CHUKO15111 745 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 GPR42O15529 346 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DNAJB6O75190 326 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CDK14O94921 469 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SERPINA7P05543 415 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TUBBP07437 444 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 COX6A1P12074 109 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 VCLP18206 1134 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CDKN2BP42772 138 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 HCAR3P49019 387 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 RENBPP51606 427 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 RPS6KA3P51812 740 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 HSD17B7P56937 341 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TPI1P60174 286 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PRR5P85299 388 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ITKQ08881 620 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TFDP2Q14188 446 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DPYSL3Q14195 570 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 KRT33BQ14525 404 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZIC1Q15915 447 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DPYSL2Q16555 572 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CCNG2Q16589 344 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 AADACL2Q6P093 401 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 COX15Q7KZN9 410 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 HOOK3Q86VS8 718 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 BEST3Q8N1M1 668 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 GDAP1Q8TB36 358 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 RNF157Q96PX1 679 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PEBP4Q96S96 227 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZNF670Q9BS34 389 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 WWP1Q9H0M0 922 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 XKR8Q9H6D3 395 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SYTL2Q9HCH5 934 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TRIM39Q9HCM9 518 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CHKBQ9Y259 395 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.3□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DYSFO75923 2080 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 A0A087X1B8 175 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 A0A0J9YYE9 177 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 A0A1W2PPR1 153 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 A0A1W2PQ67 120 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 OR2AG2A6NM03 316 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CLDN4O14493 209 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 APOL1O14791 398 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DAPK3O43293 454 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TBX1O43435 398 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SUSD5O60279 629 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CST8O60676 142 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PHF2O75151 1096 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 BMP10O95393 424 aa5.29□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TRBC1P01850 177 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms