RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 HNF4AP41235 474 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 PFKFB4Q16877 469 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ADPRMQ3LIE5 342 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 MINDY4Q4G0A6 757 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 FAAH2Q6GMR7 532 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TIFABQ6ZNK6 161 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 VN1R5Q7Z5H4 357 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 METTL21AQ8WXB1 218 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 GAL3ST3Q96A11 431 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 LHPPQ9H008 270 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 EPN3Q9H201 632 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 LANCL2Q9NS86 450 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 C4orf51C9J302 202 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 B3GALT4O96024 378 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 RAB8AP61006 207 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 Q0VFX4 171 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 IGFL3Q6UXB1 125 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 MS4A6EQ96DS6 147 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 PEX11GQ96HA9 241 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ZNF700Q9H0M5 742 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ZNF160Q9HCG1 818 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 RIC8BQ9NVN3 520 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TMCO1Q9UM00 188 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 CHST10O43529 356 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 MFSD4BQ5TF39 518 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TEX9Q8N6V9 391 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 PLPP5Q8NEB5 264 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 UBE2E3Q969T4 207 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TBC1D20Q96BZ9 403 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 DNAJB6O75190 326 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 FHP07954 510 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TLE1Q04724 770 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 PCOLCEQ15113 449 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 LAS2Q8IYD9 372 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 CCT6BQ92526 530 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 XPR1Q9UBH6 696 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ERI3O43414 337 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 OLR1P78380 273 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 RHAGQ02094 409 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ADNP2Q6IQ32 1131 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 GRHL2Q6ISB3 625 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 KBTBD2Q8IY47 623 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 OR2L5Q8NG80 312 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 FAR2Q96K12 515 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 AGAP4Q96P64 663 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 E2F3O00716 465 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 JAK1P23458 1154 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SERPINB1P30740 379 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PIK3CGP48736 1102 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 NADK2Q4G0N4 442 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MED27Q6P2C8 311 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 LANCL3Q6ZV70 420 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 LCA5Q86VQ0 697 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TM9SF4Q92544 642 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SCYL1Q96KG9 808 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 IMMP1LQ96LU5 166 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 CCDC77Q9BR77 488 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 A0A088AWK7 358 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 OR2W5A6NFC9 320 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 LRRC14BA6NHZ5 514 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MAGEB17A8MXT2 336 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 STX16O14662 325 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 UGDHO60701 494 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 SERPINA7P05543 415 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PRR35P0CG20 571 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 BTN3A2P78410 334 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 GTF2H2Q13888 395 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 LIPJQ5W064 366 aa23.44■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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