RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLIC1O00299 241 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 VNN2O95498 520 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C22orf31O95567 290 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 VIPP01282 170 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CD48P09326 243 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CA5AP35218 305 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SSR2P43308 183 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KEAP1Q14145 624 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR2L3Q8NG85 312 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ACDQ96AP0 544 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FCRL5Q96RD9 977 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DUSP26Q9BV47 211 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.66□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FLRT2O43155 660 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR1I1O60431 355 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C1RP00736 705 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IFNA2P01563 188 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC1A2P43004 574 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FLT3LGP49771 235 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DAOAP59103 153 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 VAMP2P63027 116 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EMX2Q04743 252 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CYS1Q717R9 158 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CHFRQ96EP1 664 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 POLHQ9Y253 713 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEF2O60811 474 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FUCA1P04066 466 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PIGFQ07326 219 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DPYSL2Q16555 572 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC36A3Q495N2 470 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF366Q8N895 744 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SAMD11Q96NU1 681 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ABCG8Q9H221 673 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLDN24A6NM45 220 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PI15O43692 258 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BMP1P13497 986 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRKACGP22612 351 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEA6P43360 314 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR3A2P47893 321 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CXCR4P61073 352 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C2orf80Q0P641 193 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL26Q53HC5 615 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms